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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

“一只平凡的小猪”过亿捐款引关注，幻方内部人士：是自愿捐款******

　　一则捐款信息让头部量化私募公司幻方量化在岁末年初火了一把。

　　1月9日晚间，幻方量化发布公告称，2022年度幻方量化共计向慈善机构捐赠2.2138亿元。除此以外，公司员工“一只平凡的小猪”个人向慈善机构捐赠1.38亿元。以上合计3.5938亿元均已完成打款，将支持15家慈善机构的23个公益项目。

　　“过去的几年，幻方量化及员工每年拿出收入的相当一部分投入公益，回馈社会，累计捐赠超过 5.8 亿元。”幻方量化在公告中表示。

　　“均是自愿捐款。”一位幻方量化内部人士对记者说道。

　　捐款3.5938亿元是什么水平？同花顺iFinD数据显示，2022年上半年，A股4901家上市公司中，对外有捐赠的公司为2892家，捐赠总额为54.76亿元，分上市公司来看，2022年上半年长江电力捐赠额2.71亿元居榜首，宝丰能源以2.5亿元紧随其后，伊利股份位列第三，捐赠额为2.17亿元。

　　而上述消息发布后，不少网友对“一只平凡的小猪”的真实身份十分好奇。一位业内人士猜测能一次性捐这么多钱“可能是老板或者股东”。幻方对此未作回应。

　　要知道2022年上半年非银金融行业共计捐赠1.65亿元，幻方量化员工“一只平凡的小猪”个人捐款金额据这一数字仅仅相差0.27亿元。

　　事实上，除幻方量化外，还有多家量化机构同样在慈善方面大举投入。比如鸣石基金资助了陕西省长武县巨家镇中心小学300名师生的计算机设备升级、支持了上海广慈残疾儿童福利院60余名残疾儿童的技能教育、上海财经大学数理金融实验室建设和数理人才培养等。

　　但不少业内人士还是对幻方量化如此巨额的捐款数额感到惊异，“钱从哪里来”成了大家共同的关注焦点。

　　据上述幻方量化内部人士透露，目前幻方量化规模在600亿元左右。按照业内人士的计算，如果一年管理费在1%～2%之间，年收入大概在6～12亿元之间，即使刨掉给渠道的提成(一般20%)，“也是一笔不小的收入”。

　　私募排排网数据显示，幻方量化近一年收益为12.26%，到目前为止的年化收益为18.05%。旗下共有502只基金。

　　近年来一些主观多头私募同样积极投身于公益事业。在2022年1月18日东方港湾2022年线上投资策略报告会中，公司人士表示截至当前时点，东方港湾向慈善机构、各类地方捐款累计已超人民币1.3亿元。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）